房地产开发企业进行土地增值税清算时允许扣除的项目有哪些？
一、增值额未超过扣除项目金额的20％免征的政策，仅适用于普通住宅；
二、《国家税务总局关于修订土地增值税纳税申报表的通知》（税总函〔2016〕309号）附件之土地增值税纳税申报表（二）（从事房地产开发的纳税人清算适用）明确清算的类别就是普通住宅、非普通住宅以及其他类型房地产。至于其他类房产（商铺、公寓、停车位）是否合并计算土增税，取决于它们是否属于一个清算对象，如果是，合并是必须的；
三、多缴的土地增值税如何处理的问题。根据《国家税务总局关于房地产开发企业土地增值税清算涉及企业所得税退税有关问题的公告》（国家税务总局公告2016年第81号）的规定，企业按规定对开发项目进行土地增值税清算后，当年企业所得税汇算清缴出现亏损，且没有后续开发项目的，可以按照81号公告规定的方法，计算出该项目由于土地增值税原因导致的项目开发各年度多缴企业所得税税款，并申请退税。
土增清算完毕后发生的房款如何缴纳土地增值税？
土增清算完毕后发生的房款如何缴纳土地增值税？
依据相关规定,在土地增值税清算时未转让的房地产，清算后销售或有偿转让的，纳税人应按规定进行土地增值税的纳税申报，扣除项目金额按清算时的单位建筑面积成本费用乘以销售或转让面积计算。
单位建筑面积成本费用=清算时的扣除项目总金额÷清算的总建筑面积。
在土地增值税清算完成之后再销售房地产的，不是按清算时计算的增值率计算缴纳土地增值税，而是要按当月销售额、销售成本及按规定允许的扣除项目重新计算增值额、增值率及应纳土地增值税。
在申报时，填报《土地增值税纳税申报表（四）》 （从事房地产开发的纳税人清算后尾盘销售适用）。
希望我的回答对你有所帮助。
请问房地产开发公司，房屋竣工将如何进行清算？
根据国家税务总局《关于印发土地增值税清算管理规程的通知》（国税发〔2009〕91号）规定，纳税人符合下列条件之一的，应进行土地增值税的清算：
1.已竣工验收的房地产开发项目，已转让的房地产建筑面积占整个项目可售建筑面积的比例在85%以上，或该比例虽未超过85%，但剩余的可售建筑面积已经出售或自用的；
3.纳税人申请注销税务登记但未办理土地增值税清算手续的（应在办理注销税务登记前进行土地增值税清算）。地增值税清算应报送的资料：
（一）房地产开发企业清算土地增值税书面申请、纳税申报表；
（二）项目竣工决算报表、取得土地使用权所支付的地价款凭证、国有土地使用权出让合同、银行贷款利息结算通知单、项目工程合同结算单、商品房购销合同统计表等与转让房地产的收入、成本和费用有关的证明资料；
（三）主管税务机关要求报送的其他与清算有关的证明资料等。纳税人委托税务中介机构审核鉴证的清算项目，还应报送中介机构出具的《土地增值税清算税款鉴证报告》。
土地增值税清算时房屋维修基金可以扣除吗？
可以。
房屋维修基金属于代收费用，土增规定如果代收费用计入房价向购买者一并收取的，可作为转让收入，可作为扣除项目允许扣除但是不能作为加计扣除的基；，如果单独收取的代收费用可以不作为转让收入，同时也不得作为扣除项目扣除。维修基金使用条件：1、维修基金只有在保修期满后，对物业公共部位、共用设施、设备进行大修、更新、改造时才能使用。具体业主按照投票权的确定标准分摊费用比例。
2、维修基金闲置时，除用于购买国债或法律、法规规定的其他基金范围外，禁止挪作他用。
3、特殊使用： (1)物业管理公司可从维修基金中暂借相当于一个月的物业日常维修、更新费用的备用金;物业管理服务合同另有约定的除外。(2)住宅需要大修或者专项维修、更新的，可支取施工承包合同中约定的预付款，但预付款最高不得超过工程款总额的30%。(3)业主委员会可以在物业管理企业的帐户上留有相当于一个月活动经费的备用金，业主大会另有决定的除外。
